Recuperación de Información en Bases de Datos de Tipo Bioinformático

Recuperación de Información en Bases de Datos de Tipo Bioinformático

Elizabeth Luna Luz
 

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Resumen

En la actualidad diversas instituciones tienen la necesidad de realizar la gestión de su información. La gran cantidad de datos generados provoca la dificultad en su manipulación, por lo que es relavante la formulación de aplicaciones que permitan la recuperación de datos. El Departamento de Biología Celular del Cinvestav-IPN no es ajeno a esta problemática. Por ejemplo, el laboratorio del Dr. Saúl Villa Treviño ha generado abundante información concerniente a la genómica del cáncer. Este documento aborda la problemática que enfrenta el Departamento de Biología Celular al tratar de manipular la gran cantidad de información recabada para sus investigaciones, la cual proviene de diversas bases biológicas. Por lo que se plantea como solución la creación de un sistema de información capaz de analizar, manipular y administrar dicha información con la finalidad de agilizar las investigaciones. Este proyecto trata entonces de un sistema recuperador de información dotado de reglas heurísticas de búsqueda de intereses y aplicaciones propios para datos generados en Biología Celular, mediante el uso de formas de almacenamiento y lenguajes de consulta estándares, así como de herramientas de sofware libre para la elaboración de dicho recuperador. Así la presente tesis constituye el esfuerzo interdiciplinario generado entre la interacción del Departamento de Computación y el de Biología Celular del Cinvestav. Aporta una aplicación en beneficio de la investigación.

Abstract

Nowadays, several institutions have needs for the management of their information. The huge volume of data produced has resulted difficult to be handling. The Departamento de Biología Celular del Cinvestav-IPN is no stranger to this problem. This work addresses that problem focused in the Departamento de Biología Celular where it is trying to manipulate a vast amount of information collected in its research, which comes from various biological sources. This thesis sets as a solution the creation of an information system which can analyze, manipulate and manage information in order to help and improve research activity. This project involves an Information Retrieval System (IRS) based on heuristics rules and searching of own interest and applications for Biología Celular data, using standards types of storage and query languages, as well as open software tools for the development of this IRS. .