Departamento de Computación

En esta tesis se desarrolló un sistema de software que permite la reconstrucción de volúmenes a partir de imágenes obtenidas con un tomógrafo de rayos X. Éste, también permite la visualización de superficies de los volúmenes reconstruidos. Aunque se podría pensar que el único software involucrado en el problema de reconstrucción es el que que hace funcionar el tomógrafo, se mostrará que son cinco las partes de éste, no lígadas al hardware, necesarias para resolver el problema completo de reconstrucción: (1) adquirir o las proyecciones, (2) centrar las proyecciones, (3) reconstruir el objeto, (4) segmentar las densidades del objeto reconstruido y, finalmente, (5) visualizar las isosuperficies de las densidades segmentadas. La parte de reconstrucción fue tomada de Xmipp, un software viejo diseñado para la reconstrucción en 3D de macromoléculas biológicas, la segmentación fue realizada usando el algoritmo de k-means y la visualización fue realizada por medio de la técnica de aplanamiento ("splatting", en inglés). Además se compara el aplanamiento con otras dos técnicas de visualización: voxels simples y mallas deformables. La mayor parte de los componentes de software fueron construidos en C, C++ y Perl. La interfaz gráfica fue construida en C++ con las bibliotecas Qt y OpenGL.